More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001456 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  100 
 
 		 224 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  78.95 
 
 		 207 aa  349  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  41.35 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  31.53 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.71 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  41.59 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  36.03 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 543 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.73 
 
 		 542 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.01 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 544 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.68 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.74 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.74 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.61 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.58 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  35.51 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  33.93 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 514 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  34.26 
 
 		 648 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  34.62 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  38.26 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.04 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.63 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  35.92 
 
 		 890 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  35.66 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.6 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.77 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.58 
 
 		 422 aa  71.6  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 497 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39 
 
 		 429 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 319 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.97 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.42 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30.7 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.97 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.95 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.97 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.97 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.97 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.04 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  35.09 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  34.95 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.73 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  31.3 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>