More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4669 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  98.77 
 
 		 162 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  91.41 
 
 		 163 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  85.28 
 
 		 163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  62.42 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  56.41 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  52.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  51.28 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  51.28 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  51.28 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  54.55 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  55.24 
 
 		 186 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  47.92 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  46.41 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  39.62 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  42.04 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.96 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  36.72 
 
 		 206 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.72 
 
 		 248 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 239 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  54.05 
 
 		 321 aa  85.1  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 240 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  51.35 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.19 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  41.03 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  47.31 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 544 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 498 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.95 
 
 		 607 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.14 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 543 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.5 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.75 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 294 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  51.35 
 
 		 320 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.21 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  51.43 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.19 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.6 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.09 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  44.59 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.19 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  48.65 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.22 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  44.35 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  37.25 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  44.35 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.6 
 
 		 447 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>