More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0765 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  85.28 
 
 		 172 aa  288  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  85.28 
 
 		 163 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  85.8 
 
 		 162 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  71.83 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  56.1 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  52.41 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  51.23 
 
 		 168 aa  166  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  51.23 
 
 		 168 aa  166  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  51.23 
 
 		 168 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  54.55 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  53.85 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  48.98 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  46.41 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  39.75 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.44 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.12 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 244 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 206 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.25 
 
 		 240 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.38 
 
 		 248 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 218 aa  84  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 237 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.97 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.97 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  50 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  43.69 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.6 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.93 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 463 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.14 
 
 		 607 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  48.65 
 
 		 321 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 296 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  38.32 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  38.18 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.66 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.66 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  37.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 544 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.25 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 403 aa  75.1  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  50 
 
 		 320 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.25 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  33.58 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 498 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  36.94 
 
 		 367 aa  74.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  37.25 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  51.43 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 464 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  47.14 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.84 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.94 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>