More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4667 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  329  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  91.41 
 
 		 172 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  93.21 
 
 		 162 aa  288  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  85.28 
 
 		 163 aa  270  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  71.13 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  55.13 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  53.85 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  51.28 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  51.28 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  51.28 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  55.32 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  55.94 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  48.3 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  49.02 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  48.37 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  45.22 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  40.62 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  45.39 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  45.65 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.6 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 206 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.94 
 
 		 248 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 240 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 296 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 237 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 223 aa  84  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.75 
 
 		 330 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.17 
 
 		 331 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 239 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42 
 
 		 333 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.21 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.19 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.19 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.09 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 463 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.83 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.57 
 
 		 407 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.82 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 464 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 544 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 487 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 333 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 263 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  48.65 
 
 		 318 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.92 
 
 		 533 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.09 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.6 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  34.04 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  34.53 
 
 		 533 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  54.29 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.78 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  52.86 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  51.35 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 727 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  42.74 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.22 
 
 		 542 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 464 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  42.74 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>