More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3617 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  66.88 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  56.34 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  51.28 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  54.23 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  53.85 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  50 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  53.52 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  53.15 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  50.35 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  46.1 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  46.1 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  43.67 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.28 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  37.76 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 244 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.85 
 
 		 237 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 262 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 206 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  47.57 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  47.57 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 242 aa  85.1  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  37.8 
 
 		 221 aa  84.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 206 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.46 
 
 		 248 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.6 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.46 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.46 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.09 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.74 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 523 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.71 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.24 
 
 		 331 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.46 
 
 		 263 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 261 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  38.58 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 218 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 218 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.42 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.68 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  39.32 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  40.46 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.31 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 481 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.31 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  36.24 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  36.75 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.27 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.24 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>