More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4250 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  91.77 
 
 		 168 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 165 aa  193  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  53.85 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  56.64 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  55.56 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  55.17 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  53.95 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  53.95 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  53.95 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  55.24 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  54.55 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  49.04 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  47.59 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  43.71 
 
 		 185 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  41.03 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.34 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  41.43 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  41.13 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.88 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 623 aa  94  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  43.1 
 
 		 248 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 305 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 216 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.81 
 
 		 223 aa  84.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 263 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.14 
 
 		 321 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  56.16 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  56.16 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.81 
 
 		 402 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 498 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.12 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  43.14 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 224 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  47.3 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.12 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  50 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.9 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.19 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  42.16 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.31 
 
 		 478 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.11 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 306 aa  77.4  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.45 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  46.51 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.35 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.42 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.37 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.95 
 
 		 466 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  50.68 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.25 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  41.51 
 
 		 1987 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>