More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1078 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  99.38 
 
 		 160 aa  333  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  99.38 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  98.12 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  75.16 
 
 		 161 aa  256  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  56.77 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  46.1 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  46.1 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  46.1 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  42.18 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  38.85 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  40.14 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  40.85 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40.85 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  38.19 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  38.19 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  32.08 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.9 
 
 		 244 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 264 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 239 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.34 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 237 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.89 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 497 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  40.82 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 631 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.35 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 623 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  37.76 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 485 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 481 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  43.82 
 
 		 328 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 263 aa  74.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  74.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 485 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 216 aa  73.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 485 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.54 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.12 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.12 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.62 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.45 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 487 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  34.17 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.45 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.95 
 
 		 260 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.45 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 498 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.94 
 
 		 241 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  34.91 
 
 		 484 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  40 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.19 
 
 		 669 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.8 
 
 		 337 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.32 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.25 
 
 		 367 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  33.82 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 459 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.88 
 
 		 356 aa  70.5  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  37.5 
 
 		 326 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 355 aa  70.5  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.24 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>