More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3652 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  338  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  52.69 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  47.97 
 
 
296 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.24 
 
 
415 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
224 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 
216 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.5 
 
 
407 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  47.96 
 
 
328 aa  99.4  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  35.26 
 
 
403 aa  99.4  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.22 
 
 
230 aa  98.2  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  41.41 
 
 
241 aa  97.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  37.11 
 
 
319 aa  95.5  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 
594 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  46.94 
 
 
319 aa  95.5  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
238 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 
217 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  40.97 
 
 
365 aa  94.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.55 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  42.37 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  46.94 
 
 
319 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
229 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 
221 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 
263 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 
221 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  43.09 
 
 
215 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.36 
 
 
220 aa  91.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.55 
 
 
319 aa  92  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 
263 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
228 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.36 
 
 
243 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 
263 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 
229 aa  91.3  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
221 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
456 aa  90.9  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
221 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.97 
 
 
228 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  40.71 
 
 
230 aa  90.9  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
228 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 
219 aa  90.9  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.6 
 
 
260 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 
219 aa  90.5  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 
219 aa  90.5  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 
498 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 
261 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 
236 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.7 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
262 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 
231 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.97 
 
 
217 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  38.04 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  37.19 
 
 
219 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  37.31 
 
 
225 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 
537 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  36.29 
 
 
220 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.17 
 
 
294 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 
241 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
228 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
510 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
228 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  36.76 
 
 
241 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 
213 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
362 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.58 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
263 aa  88.6  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.33 
 
 
447 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 
219 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  39.69 
 
 
510 aa  88.6  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 
223 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 
229 aa  88.2  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.8 
 
 
260 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.71 
 
 
261 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.71 
 
 
261 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.64 
 
 
212 aa  87.8  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.23 
 
 
223 aa  87.8  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
454 aa  87.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 
231 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  42.48 
 
 
159 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  39.86 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
231 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 
218 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
228 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.89 
 
 
217 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.18 
 
 
219 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.56 
 
 
321 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 
218 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>