More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4193 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  97.09 
 
 
206 aa  344  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  97.09 
 
 
206 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  71.08 
 
 
205 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.13 
 
 
231 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.09 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  36.95 
 
 
215 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 
220 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
227 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.76 
 
 
218 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
228 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.23 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.55 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
228 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.62 
 
 
228 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
219 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  46.62 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
236 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
224 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.62 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  41.61 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
229 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44.78 
 
 
261 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  44.78 
 
 
260 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  44.78 
 
 
260 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 
228 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.79 
 
 
261 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.79 
 
 
261 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
218 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
221 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
221 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
223 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
216 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
228 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 
216 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
296 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.05 
 
 
223 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.69 
 
 
205 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  43.08 
 
 
264 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  33.64 
 
 
237 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  38.36 
 
 
227 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  32.24 
 
 
225 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.44 
 
 
294 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.61 
 
 
209 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
222 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
244 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  34.5 
 
 
217 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.57 
 
 
212 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  38.83 
 
 
225 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.45 
 
 
215 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.38 
 
 
225 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 
262 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 
216 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.93 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  41.79 
 
 
263 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
241 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40 
 
 
241 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
510 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  37.41 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  37.41 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.52 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  37.41 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.52 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  45.38 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.84 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  42.23 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.46 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  30.8 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.29 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
240 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 
182 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  40.77 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  31.15 
 
 
350 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  31.15 
 
 
350 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
221 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
210 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
218 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.01 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.07 
 
 
344 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  36.23 
 
 
220 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.18 
 
 
344 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>