More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1502 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  99.62 
 
 
263 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  95.44 
 
 
263 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  95.42 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  87.55 
 
 
261 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  77.43 
 
 
260 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  77.04 
 
 
260 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  80.16 
 
 
264 aa  384  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  71.21 
 
 
261 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  71.6 
 
 
261 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  59.11 
 
 
261 aa  301  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.66 
 
 
296 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39 
 
 
286 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.25 
 
 
269 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  40.25 
 
 
269 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  38.13 
 
 
271 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  38.31 
 
 
270 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 
288 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.58 
 
 
271 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  47.71 
 
 
331 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.25 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  36.51 
 
 
270 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 
270 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  35.08 
 
 
270 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  35 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 
311 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.04 
 
 
218 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  54.29 
 
 
351 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  52.38 
 
 
210 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  54.29 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  53.33 
 
 
344 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  52.38 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  52.38 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  51.43 
 
 
344 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  51.43 
 
 
344 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  51.43 
 
 
344 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  52.38 
 
 
344 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  51.43 
 
 
345 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  51.43 
 
 
344 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.42 
 
 
669 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  47.32 
 
 
189 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 
223 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 
445 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.5 
 
 
407 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 
205 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 
236 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  43.86 
 
 
224 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.79 
 
 
248 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
1026 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  47.17 
 
 
330 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  47.86 
 
 
240 aa  99  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  43.66 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.01 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 
206 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.69 
 
 
890 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  45.61 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
506 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.65 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 
498 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.96 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.96 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.96 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.96 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  43.69 
 
 
222 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.96 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 
335 aa  96.3  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  45.61 
 
 
220 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.58 
 
 
398 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  44.63 
 
 
218 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  46.15 
 
 
337 aa  95.1  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  44.55 
 
 
183 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  44.04 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.12 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  47.12 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
374 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  49.09 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.31 
 
 
422 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.02 
 
 
294 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
222 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  45.71 
 
 
337 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.57 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 
417 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.57 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.15 
 
 
447 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  45.63 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.34 
 
 
631 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  39.85 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>