More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3484 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  51.01 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  48.97 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  47.59 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  45.39 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  41.07 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  41.07 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  45.89 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  43.2 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  44.97 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  47.3 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  43.15 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  42.24 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  43.18 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.73 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.81 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.61 
 
 		 367 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  41.24 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.71 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 471 aa  75.1  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.71 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 364 aa  74.7  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 361 aa  74.7  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.91 
 
 		 607 aa  74.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  33.62 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.62 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.22 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 228 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 356 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 623 aa  70.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 218 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  37.63 
 
 		 509 aa  70.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 218 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.82 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 560 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.19 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  30.22 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.13 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  35.16 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  35.94 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.77 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 499 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.62 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.73 
 
 		 656 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  37.86 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.18 
 
 		 333 aa  67  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  32.41 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  32.41 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>