More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1621 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  80.45 
 
 		 219 aa  337  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  79.91 
 
 		 218 aa  334  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  79.91 
 
 		 218 aa  334  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  79.19 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  74.89 
 
 		 214 aa  314  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  72.73 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  70.27 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  62.7 
 
 		 242 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  65.2 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  65.26 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  62.63 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  65.26 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  65.24 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  65.24 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  55.91 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  55.91 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  59.36 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  54 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  52.11 
 
 		 187 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  56.45 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  56.45 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  56.45 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  55.56 
 
 		 222 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  55.56 
 
 		 222 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  55.56 
 
 		 222 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  48.37 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.45 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  56.15 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  56.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  56.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  56.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  56.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  56.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  55.08 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  54.6 
 
 		 179 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  51.32 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  47.21 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  47.44 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.09 
 
 		 607 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.66 
 
 		 609 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  47.29 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.19 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  52.83 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  41.57 
 
 		 363 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  51.96 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  50 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.29 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.29 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.29 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  45.74 
 
 		 387 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  49.14 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  46.51 
 
 		 344 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  46.51 
 
 		 345 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.29 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  47.29 
 
 		 350 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  47.29 
 
 		 350 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.51 
 
 		 344 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  47.17 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 376 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.31 
 
 		 346 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.31 
 
 		 346 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 346 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 358 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  45.87 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 350 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.57 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  48.62 
 
 		 319 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.31 
 
 		 346 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.4 
 
 		 294 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 354 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 346 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.52 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 365 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  51.49 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  49.52 
 
 		 351 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  44.55 
 
 		 318 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  48.51 
 
 		 420 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 537 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  46.79 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  39.53 
 
 		 358 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>