More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2188 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  51.77 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  51.79 
 
 
217 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  44.49 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  46.86 
 
 
209 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  48.95 
 
 
224 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  48.95 
 
 
224 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  48.95 
 
 
224 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  48.95 
 
 
224 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  48.95 
 
 
224 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.15 
 
 
179 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  48.42 
 
 
224 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 
222 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 
222 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 
222 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.89 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  50.53 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  46.84 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  46.84 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  46.84 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  48.42 
 
 
215 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.42 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  51.72 
 
 
218 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 
218 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 
218 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  50.57 
 
 
217 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  49.43 
 
 
218 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  54 
 
 
357 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  54 
 
 
353 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  54 
 
 
353 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  57.94 
 
 
387 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  58.59 
 
 
373 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
218 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
218 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  53.03 
 
 
346 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  53.03 
 
 
346 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  53.03 
 
 
346 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  53.03 
 
 
365 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  53.03 
 
 
346 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  53.03 
 
 
346 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  53.03 
 
 
358 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  53.03 
 
 
354 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  53.03 
 
 
350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.4 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
219 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  51.52 
 
 
369 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  50.76 
 
 
369 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  50.76 
 
 
358 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  50.76 
 
 
371 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  50.76 
 
 
358 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  53.03 
 
 
351 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.83 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.95 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  49.24 
 
 
355 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  50 
 
 
354 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.9 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.5 
 
 
214 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  50.75 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  49.24 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  49.24 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.46 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.44 
 
 
188 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.59 
 
 
227 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  44.89 
 
 
363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.38 
 
 
607 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.56 
 
 
207 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  51.22 
 
 
355 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.45 
 
 
609 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  33.95 
 
 
243 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  43.54 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  39.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  39.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  44.17 
 
 
376 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  43.65 
 
 
223 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  43.65 
 
 
236 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  43.65 
 
 
236 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  43.65 
 
 
236 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  43.65 
 
 
236 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  43.65 
 
 
236 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  43.65 
 
 
236 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  48.41 
 
 
371 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 
276 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.26 
 
 
372 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 
371 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  46.22 
 
 
276 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 
359 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 
491 aa  94.7  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  32.42 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  40.29 
 
 
290 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  39.2 
 
 
292 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  39.57 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>