More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1340 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.57 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  51.72 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  49.22 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  50.86 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  35.81 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  47.41 
 
 		 240 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  47.75 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.15 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 187 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  37.56 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  50.89 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  49.14 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  46.85 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  40.94 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.94 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.94 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.92 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.94 
 
 		 365 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.94 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.94 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.94 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.94 
 
 		 354 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  46.09 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45 
 
 		 607 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 369 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  47.52 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.14 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  40.16 
 
 		 369 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  45.45 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  46.3 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  46.3 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  46.3 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  46.3 
 
 		 179 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  46.3 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  46.3 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  45.37 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  38.62 
 
 		 353 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  38.62 
 
 		 353 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  38.62 
 
 		 357 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  35.6 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  49 
 
 		 330 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 243 aa  95.5  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  54.84 
 
 		 321 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  45.83 
 
 		 351 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  40.31 
 
 		 358 aa  95.5  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  49 
 
 		 334 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  38.85 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  40.76 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.22 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.54 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  43.7 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  45.95 
 
 		 669 aa  92.8  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.7 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  38.31 
 
 		 363 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.48 
 
 		 609 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  39.57 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  32.2 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  32.51 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  39.57 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  39.57 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.57 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>