More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2549 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  100 
 
 		 366 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  93.72 
 
 		 361 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  75.95 
 
 		 355 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  76.15 
 
 		 354 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  74.8 
 
 		 358 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  71.12 
 
 		 353 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  71.12 
 
 		 353 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  71.12 
 
 		 357 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  72.75 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  69.21 
 
 		 369 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  68.39 
 
 		 358 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  68.29 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  68.29 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  69.21 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  68.29 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  68.11 
 
 		 365 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  68.29 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  68.39 
 
 		 369 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  68.66 
 
 		 371 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  68.11 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  68.29 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  68.39 
 
 		 358 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  68.66 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  42.08 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  31.11 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  36.26 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  32.08 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  54.81 
 
 		 232 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  31.22 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.03 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  32.9 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  51.15 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  51.15 
 
 		 224 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  51.15 
 
 		 224 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  51.15 
 
 		 224 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  51.15 
 
 		 224 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  51.15 
 
 		 224 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.15 
 
 		 179 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  50.38 
 
 		 224 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  50.38 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.38 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  50.38 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  50.38 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  50.38 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  50.38 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  50.38 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  49.24 
 
 		 225 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  50 
 
 		 217 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  50 
 
 		 219 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.49 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.92 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  27.62 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  49.61 
 
 		 215 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.61 
 
 		 215 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  48.82 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.3 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  45.8 
 
 		 831 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  45.04 
 
 		 830 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  46.56 
 
 		 831 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  44.27 
 
 		 831 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  44.27 
 
 		 831 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  40.79 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  45.8 
 
 		 830 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  28.65 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  26.15 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  44.35 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  44.35 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  44.35 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  44.7 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  25.54 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  43.55 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  43.55 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  43.55 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  43.55 
 
 		 223 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.83 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  43.51 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  43.51 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  25.14 
 
 		 321 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  43.85 
 
 		 276 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  42.97 
 
 		 218 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  45 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  44.35 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  42.97 
 
 		 217 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.55 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.55 
 
 		 271 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  41.55 
 
 		 252 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  41.55 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.55 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  41.55 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.55 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 216 aa  96.3  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  40.14 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  42.25 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  39.44 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>