More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1468 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 
218 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.22 
 
 
218 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  45.18 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  45.18 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 
242 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
187 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.58 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  43.17 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  34.6 
 
 
188 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.17 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.74 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  40.91 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.62 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.78 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  52.17 
 
 
221 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  48.12 
 
 
607 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  52.17 
 
 
221 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  52.17 
 
 
221 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  38.58 
 
 
217 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  38.58 
 
 
219 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  53.4 
 
 
222 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  54.37 
 
 
215 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.38 
 
 
220 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  52.43 
 
 
212 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 
243 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  47.54 
 
 
224 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 
237 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  51.46 
 
 
294 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
243 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  48.21 
 
 
318 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  47.57 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
239 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  47.57 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  49.51 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.57 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.3 
 
 
294 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 
216 aa  99  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  48 
 
 
311 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  48 
 
 
310 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  48 
 
 
310 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  48.18 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  51.92 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  51.92 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  48.54 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  40.11 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  50.96 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  48.21 
 
 
320 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
316 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  47 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  47 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  39.78 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  47 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  47 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  47 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.61 
 
 
468 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 
320 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  49 
 
 
277 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  47.71 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  47.37 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  45.63 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  37.63 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  38.64 
 
 
218 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  43.69 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.1 
 
 
320 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 
316 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
316 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 
242 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 
440 aa  92  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
218 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
218 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
316 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 
456 aa  91.7  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  42.31 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  42.52 
 
 
367 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  41.72 
 
 
353 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
459 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  41.72 
 
 
353 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  48.04 
 
 
510 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  41.72 
 
 
357 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
537 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  35.84 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  47.52 
 
 
402 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  48.65 
 
 
286 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.84 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
466 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  44.92 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.63 
 
 
415 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.63 
 
 
345 aa  90.1  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  47.57 
 
 
320 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>