More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1196 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  931    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  41.79 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 
464 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  41.14 
 
 
463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  40.26 
 
 
464 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  38.29 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.58 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.45 
 
 
463 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  36.39 
 
 
729 aa  226  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.69 
 
 
707 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  28.79 
 
 
652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  28.79 
 
 
652 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  29.37 
 
 
617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  27.07 
 
 
658 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  34.31 
 
 
261 aa  127  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  50.42 
 
 
451 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 
320 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  47.01 
 
 
441 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  50.42 
 
 
434 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  31.49 
 
 
642 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  32.63 
 
 
316 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 
768 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  33.19 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  31.78 
 
 
247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 
316 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.95 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  28.46 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  32.34 
 
 
310 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  32.34 
 
 
310 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  32.34 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  32.34 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  32.34 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  39.77 
 
 
653 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  32.34 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  32.34 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  32.77 
 
 
277 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
537 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  43.7 
 
 
679 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  30.21 
 
 
268 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.77 
 
 
241 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  27.88 
 
 
630 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  42.34 
 
 
424 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.72 
 
 
230 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
388 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
630 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  50.52 
 
 
334 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.73 
 
 
510 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 
215 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.53 
 
 
429 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  43.1 
 
 
326 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  48.51 
 
 
330 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.5 
 
 
321 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 
374 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.62 
 
 
542 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 
543 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 
209 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.4 
 
 
209 aa  99.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  40.38 
 
 
656 aa  99.8  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
209 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.23 
 
 
212 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.54 
 
 
319 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.47 
 
 
224 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
525 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  44.44 
 
 
533 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
222 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  45.63 
 
 
694 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.82 
 
 
217 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
544 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.4 
 
 
218 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  43.27 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.82 
 
 
217 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.9 
 
 
226 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
218 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 
229 aa  96.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.27 
 
 
294 aa  96.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
236 aa  96.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  44.44 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  43.69 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
193 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  38.36 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 
230 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  44.66 
 
 
229 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
220 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 
510 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  38.76 
 
 
641 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 
640 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
218 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.55 
 
 
266 aa  94.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  51.16 
 
 
223 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  30.48 
 
 
668 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 
673 aa  94  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 
360 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
537 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  43.27 
 
 
509 aa  93.6  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>