More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2186 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  58.08 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  57.64 
 
 		 316 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  57.27 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  58.19 
 
 		 311 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  57.33 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  57.33 
 
 		 310 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  57.21 
 
 		 316 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  57.21 
 
 		 316 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  57.21 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  57.21 
 
 		 320 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  57.02 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  55.04 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  46.75 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 		 464 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  29.22 
 
 		 463 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  30.7 
 
 		 463 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  51.81 
 
 		 85 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  51.81 
 
 		 85 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 584 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  28.63 
 
 		 729 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 420 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  28.28 
 
 		 652 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 		 652 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 231 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 		 464 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  47.52 
 
 		 402 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.05 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  36.31 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 456 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  43.27 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 220 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  39.81 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  28.07 
 
 		 464 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  39.81 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 543 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  27.16 
 
 		 642 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.23 
 
 		 542 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40.78 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  43.27 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  38.83 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  46.08 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  30.21 
 
 		 533 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  26.16 
 
 		 707 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 544 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.4 
 
 		 584 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 374 aa  85.5  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 445 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 441 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  30.68 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.75 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  29.79 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 638 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.31 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>