More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3761 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  81.68 
 
 		 584 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 584 aa  1168    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  52.99 
 
 		 590 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  30.43 
 
 		 261 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  93.6  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  29.77 
 
 		 311 aa  90.5  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 441 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.48 
 
 		 402 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.18 
 
 		 266 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  29.58 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  29.58 
 
 		 316 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.59 
 
 		 707 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.5 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.92 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.92 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.92 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 451 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.92 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.92 
 
 		 310 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.63 
 
 		 316 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.92 
 
 		 310 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.92 
 
 		 310 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  29.6 
 
 		 320 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 306 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  45.79 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  28.23 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  28.23 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  30.71 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.63 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.69 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  28.05 
 
 		 277 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.52 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  55.41 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  35.21 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4427  hypothetical protein  29.54 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  42.99 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  53.33 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.9 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6370  hypothetical protein  34.52 
 
 		 333 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 1026 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.58 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.74 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.39 
 
 		 193 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  49.28 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  44.59 
 
 		 638 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.45 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.07 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  51.35 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.3 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 637 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.58 
 
 		 694 aa  77  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  27.94 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  30.15 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  47.89 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  38.17 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  37.38 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.25 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 		 768 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  48.28 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  39.25 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  40.78 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.67 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.18 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.18 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 189 aa  73.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>