More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10918 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  100 
 
 
326 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 
459 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  52.48 
 
 
217 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  51.49 
 
 
227 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
222 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.87 
 
 
237 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
215 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
216 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45.87 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  48.54 
 
 
216 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  44.66 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  49.51 
 
 
214 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 
316 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.52 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
217 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  48.54 
 
 
221 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  43.69 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.61 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.66 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  46.6 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  48.54 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 
228 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.56 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  55.17 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  45.63 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.47 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.66 
 
 
230 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  48.54 
 
 
220 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  45.63 
 
 
229 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  51.02 
 
 
220 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  48.08 
 
 
219 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
222 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  42.72 
 
 
1313 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 
230 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
230 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  50.49 
 
 
227 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.52 
 
 
294 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.15 
 
 
707 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.27 
 
 
228 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  45.63 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
230 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  44.66 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
214 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
224 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 
320 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  48.6 
 
 
220 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.83 
 
 
510 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  43.69 
 
 
215 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  48.6 
 
 
220 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
316 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 
412 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  46.6 
 
 
217 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.42 
 
 
584 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  53.41 
 
 
187 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
219 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  51.72 
 
 
222 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.69 
 
 
214 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  29.31 
 
 
277 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.67 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
224 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.81 
 
 
670 aa  85.9  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  43.69 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  41.9 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  43.69 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
240 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.25 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
218 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>