More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1877 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  100 
 
 		 434 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  78.46 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  71.57 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1685  OmpA/MotB-like porin  62.05 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  48.72 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  50.42 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.83 
 
 		 707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 463 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  45.3 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  42.55 
 
 		 729 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  41.94 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 642 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 658 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  42.48 
 
 		 311 aa  96.3  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  38.21 
 
 		 617 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 215 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  41.59 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  41.59 
 
 		 310 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  41.59 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  41.59 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  41.59 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 316 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 241 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  41.59 
 
 		 310 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  41.59 
 
 		 310 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 498 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 658 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 653 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  34.92 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  40.52 
 
 		 505 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 316 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 768 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 316 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  41.59 
 
 		 277 aa  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.06 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 362 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 238 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 623 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.58 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 247 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.56 
 
 		 320 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 316 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 230 aa  87.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 306 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.73 
 
 		 584 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 506 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.94 
 
 		 620 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.97 
 
 		 640 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  36.44 
 
 		 641 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.5 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.47 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 584 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.83 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.04 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  39.09 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  38.94 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  36.5 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  40.74 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.19 
 
 		 670 aa  84  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  36.5 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.63 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  40.57 
 
 		 919 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 189 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.27 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.86 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 638 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>