More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3101 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  100 
 
 		 617 aa  1216    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  48.45 
 
 		 653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  46.5 
 
 		 652 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  46.33 
 
 		 652 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  47.38 
 
 		 642 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  44.59 
 
 		 658 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 768 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 		 729 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  29.1 
 
 		 464 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  29.67 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.02 
 
 		 707 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  27 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  27 
 
 		 464 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  26.71 
 
 		 463 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  28.61 
 
 		 463 aa  94.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.28 
 
 		 320 aa  94  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 434 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  31.25 
 
 		 310 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  31.25 
 
 		 310 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  31.25 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  31.25 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  31.25 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  31.25 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.09 
 
 		 316 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 		 316 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  30.8 
 
 		 316 aa  90.5  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 510 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 320 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 623 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.96 
 
 		 247 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.29 
 
 		 316 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  30.74 
 
 		 311 aa  88.2  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  44.64 
 
 		 277 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.55 
 
 		 402 aa  87.8  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.25 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.62 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  37.14 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.99 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36.89 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 543 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.37 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1987 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  38.46 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.21 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.42 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  40.2 
 
 		 890 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.13 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.29 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  31.31 
 
 		 712 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  40.59 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.81 
 
 		 321 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 193 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.39 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  39.22 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.63 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  34.26 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.24 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 658 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39 
 
 		 398 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.38 
 
 		 230 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  41.74 
 
 		 267 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  27.56 
 
 		 268 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 189 aa  72.8  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>