More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0175 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 		 584 aa  1163    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  81.68 
 
 		 584 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  53.5 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  30.19 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  42.86 
 
 		 266 aa  96.3  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.22 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 441 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6370  hypothetical protein  35.21 
 
 		 333 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  28.75 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  28.75 
 
 		 316 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.04 
 
 		 316 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.51 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.51 
 
 		 310 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  28.63 
 
 		 316 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  28.4 
 
 		 261 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  29.6 
 
 		 320 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 306 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  29.45 
 
 		 277 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  28.23 
 
 		 247 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  28.23 
 
 		 316 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.64 
 
 		 320 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  46.73 
 
 		 434 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.67 
 
 		 707 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.93 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 445 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  55.41 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4427  hypothetical protein  29.33 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  42.86 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.69 
 
 		 320 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  54.67 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  54.67 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  42.99 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  54.67 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  26.32 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.51 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 		 729 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 1026 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 658 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.74 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 		 220 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  41.67 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.2 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.22 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  49.3 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  32.37 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.64 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.39 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  39.25 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 768 aa  77  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.98 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.37 
 
 		 224 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.99 
 
 		 220 aa  77  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 345 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 417 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  48.15 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  38.53 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40.18 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  52.94 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  42.11 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>