More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5618 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  98.64 
 
 
220 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  89.55 
 
 
220 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  89.55 
 
 
220 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  89.55 
 
 
239 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  59.38 
 
 
224 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  63.13 
 
 
220 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  61.08 
 
 
221 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  61.08 
 
 
221 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  61.08 
 
 
221 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  60.39 
 
 
224 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  59.9 
 
 
220 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  49.52 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 
248 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  43.29 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.21 
 
 
231 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.43 
 
 
267 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 
242 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.43 
 
 
235 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  42.36 
 
 
234 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
266 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  35.98 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  37.14 
 
 
236 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  46.72 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  35.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.96 
 
 
242 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.31 
 
 
240 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 
239 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  50.48 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.64 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  44.96 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  43.64 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  46.36 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  46.36 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.05 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.17 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  51.49 
 
 
321 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.02 
 
 
330 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  46.3 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.52 
 
 
352 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.74 
 
 
607 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  43.24 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  46.3 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.51 
 
 
509 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 
499 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.95 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  47.62 
 
 
415 aa  89  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  31.25 
 
 
367 aa  89  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  47.57 
 
 
318 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  45.67 
 
 
355 aa  88.6  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
247 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
236 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  47.52 
 
 
334 aa  88.2  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.04 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.51 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.1 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
459 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 
537 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  42.28 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
231 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  45.24 
 
 
464 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  48.6 
 
 
326 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  46.6 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  54.93 
 
 
321 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.94 
 
 
316 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  40.54 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  48.51 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  44.14 
 
 
261 aa  84.7  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>