More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0482 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 		 620 aa  1289    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  41.81 
 
 		 640 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.44 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.13 
 
 		 673 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 631 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.87 
 
 		 630 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  35.51 
 
 		 519 aa  299  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  31.85 
 
 		 648 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.44 
 
 		 638 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 658 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.31 
 
 		 694 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 704 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.47 
 
 		 669 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.61 
 
 		 670 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.04 
 
 		 631 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  33.27 
 
 		 517 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  32.24 
 
 		 673 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 525 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.12 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.47 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 668 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.22 
 
 		 510 aa  206  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.7 
 
 		 648 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.26 
 
 		 626 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.58 
 
 		 656 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 671 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.39 
 
 		 666 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 		 650 aa  183  9.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.56 
 
 		 672 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.9 
 
 		 712 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.6 
 
 		 679 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  25.38 
 
 		 665 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  26.24 
 
 		 677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  27.29 
 
 		 645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.31 
 
 		 903 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.76 
 
 		 710 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.14 
 
 		 630 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  24.51 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35.81 
 
 		 1313 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  24.89 
 
 		 613 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 712 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.82 
 
 		 798 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.76 
 
 		 412 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  32.55 
 
 		 432 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  30.88 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.72 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  48.21 
 
 		 364 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  26.21 
 
 		 757 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  49.52 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  47.79 
 
 		 364 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.05 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.31 
 
 		 239 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  26.71 
 
 		 504 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.8 
 
 		 424 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  46.96 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  45.61 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  43.2 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  44.63 
 
 		 350 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.22 
 
 		 365 aa  99.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 337 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 778 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  49.51 
 
 		 229 aa  97.4  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 506 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  44.44 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  47.12 
 
 		 464 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  45.13 
 
 		 333 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  47.12 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 440 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 		 454 aa  94.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 361 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 623 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.12 
 
 		 375 aa  94.4  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.54 
 
 		 374 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 464 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 375 aa  94  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 456 aa  94  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 729 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 335 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 459 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 286 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.71 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.55 
 
 		 321 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 240 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.36 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 193 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>