More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1796 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  100 
 
 		 903 aa  1862    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.83 
 
 		 671 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 668 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.03 
 
 		 648 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.69 
 
 		 679 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.73 
 
 		 656 aa  223  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.39 
 
 		 626 aa  221  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.64 
 
 		 673 aa  221  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  26.37 
 
 		 631 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.45 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 658 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.42 
 
 		 650 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  34.07 
 
 		 665 aa  207  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  28.12 
 
 		 641 aa  205  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 		 613 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  25.74 
 
 		 638 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.85 
 
 		 640 aa  200  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 643 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.44 
 
 		 710 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 		 677 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 		 660 aa  191  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  26.44 
 
 		 630 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.65 
 
 		 648 aa  177  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.23 
 
 		 672 aa  176  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.93 
 
 		 630 aa  176  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.03 
 
 		 631 aa  172  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  25.52 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.45 
 
 		 642 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.55 
 
 		 653 aa  169  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 		 645 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.31 
 
 		 620 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  28.82 
 
 		 712 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 594 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 		 537 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  31.94 
 
 		 669 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 		 704 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 525 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.04 
 
 		 712 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  27.4 
 
 		 757 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.96 
 
 		 694 aa  135  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.38 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  27.75 
 
 		 670 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 798 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 778 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.6 
 
 		 510 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 585 aa  121  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.05 
 
 		 673 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.19 
 
 		 734 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  27.41 
 
 		 517 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.35 
 
 		 509 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  27.99 
 
 		 519 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 		 813 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  36.97 
 
 		 471 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 187 aa  95.5  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 188 aa  92  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 230 aa  90.9  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.67 
 
 		 320 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 		 542 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 1026 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 543 aa  87.8  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.5 
 
 		 424 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 224 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  41.51 
 
 		 261 aa  87  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 228 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35.29 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.42 
 
 		 158 aa  85.5  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.6 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.19 
 
 		 199 aa  84  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.38 
 
 		 415 aa  84  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 217 aa  84  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 568 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 239 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.86 
 
 		 261 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 260 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 219 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 240 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 261 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.86 
 
 		 261 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  41.23 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.5 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.24 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 193 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.79 
 
 		 260 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 		 244 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.45 
 
 		 334 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 218 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.51 
 
 		 211 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.42 
 
 		 170 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 218 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 262 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  32.61 
 
 		 225 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.96 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  37.96 
 
 		 318 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>