68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1454 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  100 
 
 		 504 aa  1040    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.55 
 
 		 509 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  27.21 
 
 		 630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  25.96 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  25.3 
 
 		 631 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.52 
 
 		 517 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  27.29 
 
 		 641 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.46 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.48 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  23.72 
 
 		 658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  25.53 
 
 		 638 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  25.11 
 
 		 670 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.71 
 
 		 620 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  24.44 
 
 		 694 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  23.6 
 
 		 669 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.58 
 
 		 673 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  24.67 
 
 		 525 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  25.53 
 
 		 640 aa  87  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  30.88 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  23.38 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  24.82 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  33.58 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  25.52 
 
 		 673 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.21 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  23.19 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  23.71 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  24.43 
 
 		 679 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.42 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  23.27 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  21.5 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  30.27 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  24.54 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  24.88 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  21.25 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.17 
 
 		 656 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 		 645 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  27.54 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  27.06 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  26.69 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  24.88 
 
 		 642 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  26.98 
 
 		 789 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.32 
 
 		 613 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  23.87 
 
 		 710 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  29.31 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  22.71 
 
 		 660 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  42.42 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  31.68 
 
 		 297 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.32 
 
 		 665 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  23.53 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  31.74 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 757 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  24.06 
 
 		 666 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.97 
 
 		 671 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  37.14 
 
 		 344 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  31.51 
 
 		 309 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  28.04 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  31.43 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 306 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>