More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2715 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 		 673 aa  1387    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.67 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  37.08 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.23 
 
 		 648 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  33.27 
 
 		 631 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.77 
 
 		 658 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  40.1 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.02 
 
 		 656 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.4 
 
 		 630 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 		 638 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 648 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.44 
 
 		 668 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.54 
 
 		 631 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.67 
 
 		 669 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.93 
 
 		 626 aa  237  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.3 
 
 		 671 aa  234  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.61 
 
 		 656 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.71 
 
 		 672 aa  231  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.51 
 
 		 903 aa  230  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.1 
 
 		 665 aa  229  9e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.24 
 
 		 694 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 537 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  28.46 
 
 		 643 aa  223  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.55 
 
 		 679 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 704 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.3 
 
 		 653 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.65 
 
 		 650 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  31.26 
 
 		 630 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  29.51 
 
 		 670 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 		 660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 798 aa  198  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  30.13 
 
 		 673 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 757 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.13 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.92 
 
 		 510 aa  187  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  26.05 
 
 		 666 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.51 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.49 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.19 
 
 		 642 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.43 
 
 		 712 aa  170  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  24.33 
 
 		 677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  26.28 
 
 		 778 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  27.24 
 
 		 813 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  27.35 
 
 		 712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  25.98 
 
 		 585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.46 
 
 		 613 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.91 
 
 		 594 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  44.03 
 
 		 734 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.53 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 432 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  36.81 
 
 		 1313 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 412 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.62 
 
 		 230 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 		 1755 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  47.62 
 
 		 240 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 543 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.98 
 
 		 422 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.44 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.37 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  43 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.82 
 
 		 239 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 241 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 374 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  32.04 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 544 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 		 362 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.86 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 388 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.31 
 
 		 319 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  45.79 
 
 		 266 aa  97.8  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1987 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 623 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  42.62 
 
 		 217 aa  97.4  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  32.12 
 
 		 263 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  48 
 
 		 367 aa  97.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  46.15 
 
 		 217 aa  96.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 230 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 226 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  47.75 
 
 		 375 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  45.05 
 
 		 351 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 230 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 230 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 231 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.23 
 
 		 365 aa  94.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  45.71 
 
 		 224 aa  94.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 		 209 aa  94.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.35 
 
 		 424 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.42 
 
 		 320 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  26.57 
 
 		 306 aa  94  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 200 aa  94  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 335 aa  93.6  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  41.44 
 
 		 1793 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.4 
 
 		 261 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  46.23 
 
 		 321 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  44.12 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>