88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02820 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  42.58 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  45.11 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  38.34 
 
 		 658 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.89 
 
 		 640 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  32.31 
 
 		 641 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.12 
 
 		 673 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 		 648 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  35.71 
 
 		 626 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 668 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  31.52 
 
 		 643 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.87 
 
 		 631 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.13 
 
 		 671 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 		 638 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 		 631 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.98 
 
 		 712 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 		 653 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.32 
 
 		 519 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.1 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 813 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.71 
 
 		 645 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  32.02 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  33.53 
 
 		 656 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 798 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 		 650 aa  79.7  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 586 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 679 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.33 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.17 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  33.33 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  28.79 
 
 		 594 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.22 
 
 		 642 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.64 
 
 		 620 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.9 
 
 		 734 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  32.97 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 		 613 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  27.06 
 
 		 665 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.68 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.89 
 
 		 903 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  36.96 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.3 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 677 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  32.35 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 778 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  25.85 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.21 
 
 		 648 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  32.58 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  40 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  29.88 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  27.54 
 
 		 504 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.95 
 
 		 710 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  31.98 
 
 		 789 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.66 
 
 		 669 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.27 
 
 		 1097 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.38 
 
 		 704 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.78 
 
 		 670 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  26.6 
 
 		 620 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 673 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 537 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  39.24 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  25.12 
 
 		 629 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  31.52 
 
 		 956 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.1 
 
 		 683 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  29.21 
 
 		 618 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.13 
 
 		 340 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.62 
 
 		 694 aa  45.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  34.52 
 
 		 687 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.85 
 
 		 572 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.47 
 
 		 685 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.44 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.9 
 
 		 684 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  25.74 
 
 		 430 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  31.31 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.37 
 
 		 1005 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.9 
 
 		 684 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 525 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.35 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  28.95 
 
 		 684 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  32.35 
 
 		 347 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  23.53 
 
 		 430 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  25.36 
 
 		 354 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 		 687 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 969 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>