More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3950 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  54.12 
 
 
666 aa  741    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
653 aa  1336    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  52.13 
 
 
643 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  47.58 
 
 
650 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  46.21 
 
 
665 aa  578  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  44.75 
 
 
660 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 
642 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  38.89 
 
 
626 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 
645 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  41.78 
 
 
712 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  35.19 
 
 
630 aa  342  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.61 
 
 
677 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 
648 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 
668 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  30.68 
 
 
798 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.25 
 
 
757 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.69 
 
 
734 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  28.9 
 
 
656 aa  243  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  30.5 
 
 
813 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.09 
 
 
672 aa  213  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.16 
 
 
673 aa  203  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.77 
 
 
671 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 
631 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
658 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 
638 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.81 
 
 
585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.52 
 
 
641 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.86 
 
 
640 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  29.5 
 
 
471 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.55 
 
 
903 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  24.96 
 
 
613 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.51 
 
 
656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.45 
 
 
631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 
679 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  25.39 
 
 
620 aa  163  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 
340 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.73 
 
 
778 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.78 
 
 
648 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.73 
 
 
712 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  27.27 
 
 
670 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.76 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.62 
 
 
710 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.41 
 
 
510 aa  130  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  25.59 
 
 
694 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.6 
 
 
673 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.54 
 
 
704 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  25.67 
 
 
525 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.93 
 
 
669 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  47.27 
 
 
366 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.07 
 
 
509 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  27.67 
 
 
586 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 
594 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  23.6 
 
 
517 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.89 
 
 
519 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  30.32 
 
 
412 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  34.87 
 
 
263 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.16 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  25.23 
 
 
1313 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  28.64 
 
 
789 aa  80.5  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  26.04 
 
 
464 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  28.26 
 
 
427 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  27.19 
 
 
505 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  30.85 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.36 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.36 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.77 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  34.25 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  31.2 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 
1755 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
231 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 
322 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  21.03 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.25 
 
 
187 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.65 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
544 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.03 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.42 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.61 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  31.22 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  34.21 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.91 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  33.62 
 
 
402 aa  67  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  36.94 
 
 
1793 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.77 
 
 
320 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  32.76 
 
 
193 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 
230 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  30.08 
 
 
365 aa  65.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.04 
 
 
226 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>