More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01035 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  100 
 
 		 630 aa  1291    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 		 645 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 642 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  35.31 
 
 		 665 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 650 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 653 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  35.25 
 
 		 626 aa  341  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 666 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 643 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  33.75 
 
 		 660 aa  317  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.59 
 
 		 677 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.46 
 
 		 648 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  25.36 
 
 		 757 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.92 
 
 		 668 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.17 
 
 		 656 aa  213  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.26 
 
 		 673 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.78 
 
 		 712 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 		 613 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 671 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.06 
 
 		 672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.5 
 
 		 640 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.93 
 
 		 903 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.17 
 
 		 641 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.66 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 813 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  30.33 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  25.57 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.57 
 
 		 658 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.14 
 
 		 620 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.62 
 
 		 734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.45 
 
 		 694 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  24.68 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.34 
 
 		 656 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.37 
 
 		 669 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.06 
 
 		 710 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  24.9 
 
 		 670 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.12 
 
 		 712 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  32.39 
 
 		 471 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  23.68 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  23.83 
 
 		 673 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  40.41 
 
 		 778 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  24.81 
 
 		 631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.83 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 638 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.3 
 
 		 704 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.13 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.11 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.12 
 
 		 537 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.68 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.12 
 
 		 594 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  41.96 
 
 		 366 aa  92  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 362 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 623 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.49 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 170 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 170 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.44 
 
 		 190 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  35.34 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.32 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.38 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  25.36 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.72 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.37 
 
 		 188 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.51 
 
 		 165 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.83 
 
 		 185 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  28.33 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 1755 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.2 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  34.4 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  40 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  33.64 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.92 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  43.21 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.89 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.14 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  33.91 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.19 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 		 172 aa  73.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.18 
 
 		 172 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 193 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 165 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 166 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02683  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.04 
 
 		 194 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.7 
 
 		 1313 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.45 
 
 		 170 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>