More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5477 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 637 aa  1280    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1987 aa  306  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.22 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  51.03 
 
 		 374 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  49.61 
 
 		 1755 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  32.41 
 
 		 671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  50.97 
 
 		 490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.18 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  45.33 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.61 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 727 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.85 
 
 		 543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.85 
 
 		 542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 544 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  53.72 
 
 		 792 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 386 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.34 
 
 		 319 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.43 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  49.03 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  40.07 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  45.54 
 
 		 722 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.08 
 
 		 447 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.39 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 		 1264 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.82 
 
 		 402 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.88 
 
 		 320 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.33 
 
 		 294 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 		 506 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  27.69 
 
 		 570 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.44 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.35 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  52.89 
 
 		 193 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.86 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 322 aa  117  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  38.31 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.9 
 
 		 429 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  51.38 
 
 		 1793 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.71 
 
 		 314 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  36.32 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 		 401 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.56 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  40.15 
 
 		 656 aa  98.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 175 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.14 
 
 		 445 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 388 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.48 
 
 		 217 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 217 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  41.67 
 
 		 670 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.59 
 
 		 517 aa  94.4  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40 
 
 		 669 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  39.29 
 
 		 734 aa  94  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.81 
 
 		 380 aa  93.6  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.12 
 
 		 375 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.12 
 
 		 375 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 174 aa  93.2  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.55 
 
 		 362 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 260 aa  93.6  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 342 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.65 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  41.82 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.66 
 
 		 344 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 671 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.66 
 
 		 344 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 261 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 594 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 459 aa  90.9  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.94 
 
 		 345 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  44.14 
 
 		 239 aa  90.5  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.76 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.36 
 
 		 351 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 648 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  43.24 
 
 		 640 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  44.04 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 340 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 372 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.46 
 
 		 350 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 263 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  34.64 
 
 		 370 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 296 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.46 
 
 		 350 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 193 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 263 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 360 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 668 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 344 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 660 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 224 aa  88.2  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  37.58 
 
 		 352 aa  88.2  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 373 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.01 
 
 		 344 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 372 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>