More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1705 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
340 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  41.01 
 
 
650 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
660 aa  179  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  40.44 
 
 
653 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  38.43 
 
 
643 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  34.57 
 
 
666 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  36.04 
 
 
665 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
642 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  46.56 
 
 
677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  34.36 
 
 
798 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 
585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 
645 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 
757 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  35.62 
 
 
668 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  38.22 
 
 
813 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.22 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  42.5 
 
 
734 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 
648 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  31.3 
 
 
630 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 
671 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
712 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  30.46 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 
637 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  28.52 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.57 
 
 
509 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
1755 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  35.65 
 
 
656 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  40.7 
 
 
568 aa  82.4  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 
679 aa  82.8  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.96 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  33.33 
 
 
710 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.94 
 
 
640 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
630 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  36.61 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.75 
 
 
673 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.64 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.59 
 
 
638 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  35.4 
 
 
1793 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 
658 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.93 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.67 
 
 
641 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  32.26 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.47 
 
 
672 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.85 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25 
 
 
903 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.63 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.11 
 
 
422 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 
193 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.04 
 
 
670 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
543 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.14 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  29.5 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  34.48 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  31.86 
 
 
1987 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.43 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  30.58 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
454 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.64 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
241 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  31.93 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
544 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.14 
 
 
190 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 
542 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 
594 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
623 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  30.97 
 
 
653 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  42.71 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 
537 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  32.99 
 
 
704 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  31.19 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  31.86 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 
445 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.09 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.56 
 
 
478 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  31.53 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.43 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  31.53 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.03 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.78 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 
1026 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 
180 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  25.9 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>