More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4205 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 427 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 432 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.37 
 
 		 670 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.91 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.65 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.66 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 673 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 525 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.57 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.22 
 
 		 694 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 630 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.35 
 
 		 669 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.55 
 
 		 641 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 658 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.88 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  48.74 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.71 
 
 		 640 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  42.24 
 
 		 1313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  45.97 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.94 
 
 		 656 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.88 
 
 		 620 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.86 
 
 		 631 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.63 
 
 		 509 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 671 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  45.83 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 679 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  47.75 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  48.96 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  33.13 
 
 		 631 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.67 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 586 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 241 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 		 645 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.97 
 
 		 542 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 270 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 		 638 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 543 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.07 
 
 		 294 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 544 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 648 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 668 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.5 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.18 
 
 		 269 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.72 
 
 		 239 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 498 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 337 aa  90.1  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 594 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 440 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 1026 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  39.29 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.15 
 
 		 673 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.37 
 
 		 224 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0081  hypothetical protein  34.81 
 
 		 184 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.25 
 
 		 478 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 623 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 319 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.68 
 
 		 734 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 506 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 270 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 270 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 218 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  41.6 
 
 		 626 aa  86.3  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 193 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.22 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 1755 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 757 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.83 
 
 		 707 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.45 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.45 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  36.28 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.9 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.45 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 216 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.45 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>