More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1655 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  95.19 
 
 		 270 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  92.83 
 
 		 270 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  75.46 
 
 		 270 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  72.32 
 
 		 271 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  71.96 
 
 		 271 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  67.65 
 
 		 270 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  67.73 
 
 		 269 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  68.44 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  56.18 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.72 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.72 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.04 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.22 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.22 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.47 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  36.59 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.33 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.56 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  44.85 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 		 311 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  44.14 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.41 
 
 		 890 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  46.23 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.2 
 
 		 631 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.72 
 
 		 209 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.9 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 537 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 416 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 587 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 374 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 417 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  47.12 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.28 
 
 		 209 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  38.39 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.45 
 
 		 542 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 543 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 575 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 630 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 427 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 348 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.68 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45.63 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40.95 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 205 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.34 
 
 		 217 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 226 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.84 
 
 		 239 aa  85.9  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  44.55 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.65 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  39.64 
 
 		 185 aa  85.5  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  44.55 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 498 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 200 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.28 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.12 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.89 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.89 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  40.71 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  39.62 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  42.45 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>