More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0416 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  100 
 
 		 1313 aa  2694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  42.01 
 
 		 670 aa  146  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  44.24 
 
 		 510 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.11 
 
 		 517 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 525 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 673 aa  135  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 537 aa  131  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  39.11 
 
 		 704 aa  131  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 412 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  37.04 
 
 		 620 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.27 
 
 		 669 aa  122  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35.61 
 
 		 631 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.22 
 
 		 641 aa  118  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  48.7 
 
 		 424 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.88 
 
 		 694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 432 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  44.52 
 
 		 380 aa  114  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 427 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  49.17 
 
 		 505 aa  112  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  48.7 
 
 		 306 aa  111  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 658 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.39 
 
 		 640 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.02 
 
 		 656 aa  107  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 241 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 679 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 638 aa  99.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.81 
 
 		 673 aa  99  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.77 
 
 		 671 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 374 aa  95.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 		 464 aa  95.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.83 
 
 		 509 aa  95.1  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 193 aa  94.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  36.14 
 
 		 631 aa  94.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  36.5 
 
 		 734 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 		 388 aa  94  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 189 aa  91.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40 
 
 		 320 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 440 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  42.72 
 
 		 326 aa  89.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 459 aa  89  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 361 aa  88.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 248 aa  88.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 		 399 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  31.15 
 
 		 239 aa  87.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 594 aa  87.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 227 aa  87.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.37 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 231 aa  84.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 445 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 230 aa  83.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  25.23 
 
 		 653 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  31.95 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 		 369 aa  83.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 		 668 aa  83.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.3 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 544 aa  82.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  40.38 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.75 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 398 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  40.2 
 
 		 311 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.5 
 
 		 542 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 463 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  33.11 
 
 		 533 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 490 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40.68 
 
 		 318 aa  80.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 238 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 440 aa  80.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  43.82 
 
 		 224 aa  79.7  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.54 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 1026 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  33.11 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 666 aa  79  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 1264 aa  78.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.59 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.06 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 319 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 175 aa  78.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  44.05 
 
 		 261 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 643 aa  78.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 658 aa  77.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 360 aa  77.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 613 aa  78.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 653 aa  77  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>