More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3582 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 366 aa  751    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 658 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 241 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.42 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  40.57 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 638 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.59 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.42 
 
 		 1313 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.38 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  35.59 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  39.45 
 
 		 222 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  36.54 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  36.54 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  38.1 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 525 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  35.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  35.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  35.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  35.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  38.68 
 
 		 670 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  35.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  35.59 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 175 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.47 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.53 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.58 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.45 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.68 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.33 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.23 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 830 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 224 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  30.22 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.46 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  33.59 
 
 		 830 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.36 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  38.32 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.53 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  26.95 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 831 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36.45 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  35 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.08 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.26 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.81 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.32 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.32 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  33.33 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.08 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.17 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1987 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 1026 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  37.35 
 
 		 85 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.54 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>