More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0605 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.25 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.02 
 
 		 505 aa  95.5  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  42.59 
 
 		 380 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  48.04 
 
 		 424 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 366 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  36.87 
 
 		 1313 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  31.92 
 
 		 620 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.49 
 
 		 670 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.41 
 
 		 517 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  31.34 
 
 		 704 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.4 
 
 		 658 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.29 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.16 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  36.89 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.71 
 
 		 641 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 673 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1687  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  32.42 
 
 		 432 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.92 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.68 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.56 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.56 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.54 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.74 
 
 		 694 aa  75.9  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 		 630 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.65 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 449 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 333 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.71 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 729 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.33 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  42.27 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  38.24 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 333 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.69 
 
 		 712 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.57 
 
 		 669 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  30.49 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.09 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  35.16 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  41.75 
 
 		 631 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  32.82 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 1026 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  38.53 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.21 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  37.35 
 
 		 85 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  37.35 
 
 		 85 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.34 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  33.33 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>