More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4921 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 320 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  79.93 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  78.72 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  78.72 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  78.72 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  78.72 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  73.83 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  78.91 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  78.91 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  78.72 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  72.9 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  79.12 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  78.79 
 
 		 316 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  77.44 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  87.03 
 
 		 247 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  76.77 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  67.36 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  57.46 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  53.57 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  83.33 
 
 		 85 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  83.33 
 
 		 85 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  33.2 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 459 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  34.82 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  32.9 
 
 		 464 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  30.9 
 
 		 464 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.2 
 
 		 707 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  30.36 
 
 		 464 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  31.58 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 		 729 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  28.34 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 227 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.42 
 
 		 525 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 704 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 222 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 533 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 231 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  49.49 
 
 		 227 aa  95.9  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 510 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 543 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 537 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.66 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.35 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  42.59 
 
 		 533 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 456 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 		 220 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 		 219 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 440 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 642 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 224 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.08 
 
 		 542 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.5 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 544 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  43 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  29.83 
 
 		 652 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  29.83 
 
 		 652 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 490 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  32.37 
 
 		 658 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 193 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  31.25 
 
 		 617 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 449 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 218 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 218 aa  90.1  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 441 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.4 
 
 		 214 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.55 
 
 		 402 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.14 
 
 		 266 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 420 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 440 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 242 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  41.58 
 
 		 222 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40.4 
 
 		 212 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  46.46 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  42 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 216 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 451 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 216 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.13 
 
 		 248 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 217 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  30.93 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 432 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>