More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0772 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  100 
 
 		 464 aa  918    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  76.29 
 
 		 464 aa  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  72.84 
 
 		 464 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  88.36 
 
 		 464 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  65.73 
 
 		 464 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  64.01 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  67.46 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 729 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.25 
 
 		 707 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  35.69 
 
 		 630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  29.4 
 
 		 612 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  31.63 
 
 		 768 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  29.59 
 
 		 652 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  32.07 
 
 		 277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  30.82 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  30.4 
 
 		 320 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.07 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  45.3 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.37 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  27.52 
 
 		 617 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  29.96 
 
 		 311 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  26.79 
 
 		 658 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.96 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  31.2 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  30.91 
 
 		 669 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  31.6 
 
 		 670 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  28 
 
 		 653 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  31.05 
 
 		 668 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  28.94 
 
 		 684 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 230 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  28.51 
 
 		 261 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40 
 
 		 694 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 319 aa  88.2  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.68 
 
 		 217 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  41.58 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 217 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 218 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 658 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.75 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.32 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 236 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.42 
 
 		 656 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.97 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 640 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 217 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.04 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.38 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.42 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  38.1 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  44.57 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.79 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  34.92 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  35.56 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  29.79 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  55.88 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 679 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.02 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.88 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.33 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  36.89 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>