49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3382 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  80.99 
 
 		 668 aa  957    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1295    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  81.02 
 
 		 669 aa  967    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  48.45 
 
 		 630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  44.1 
 
 		 612 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  47.44 
 
 		 684 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 		 729 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.51 
 
 		 707 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 464 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  29.43 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  31.62 
 
 		 464 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  29.29 
 
 		 464 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 459 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  27.91 
 
 		 464 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  29.58 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  28.07 
 
 		 463 aa  99.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  31.67 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  28.41 
 
 		 320 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  26.55 
 
 		 652 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  26.55 
 
 		 652 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  25.57 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  26.7 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  25.57 
 
 		 316 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  25.57 
 
 		 316 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  26.14 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.57 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  26.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  26.7 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  25 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004310  BR0640  hypothetical protein  27.06 
 
 		 213 aa  55.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  25 
 
 		 617 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0635  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  22.73 
 
 		 261 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  25.47 
 
 		 768 aa  50.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  23.58 
 
 		 653 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  30.14 
 
 		 658 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  26.83 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  32.63 
 
 		 241 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  32.18 
 
 		 451 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 231 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>