More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0626 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 768 aa  1486    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  48.63 
 
 		 652 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  48.63 
 
 		 652 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  49.41 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  46.35 
 
 		 653 aa  465  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  44.12 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 658 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  31.49 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  29.74 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  32.35 
 
 		 464 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  31.53 
 
 		 463 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  32.49 
 
 		 464 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 		 459 aa  119  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 463 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 441 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.14 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  27.08 
 
 		 729 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  41.8 
 
 		 451 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  28.57 
 
 		 509 aa  95.1  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.12 
 
 		 266 aa  91.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.62 
 
 		 694 aa  90.9  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.15 
 
 		 478 aa  89.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  42.99 
 
 		 402 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 		 537 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 434 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 335 aa  88.6  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 537 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 296 aa  87.8  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 525 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.81 
 
 		 620 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  39.58 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  45.45 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.74 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.25 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.38 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 		 316 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.5 
 
 		 422 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 440 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.38 
 
 		 669 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 263 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  28.4 
 
 		 277 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  40.38 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.9 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.06 
 
 		 218 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  28.34 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.45 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  35.25 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.24 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  28.34 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 1026 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  40.45 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.86 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.9 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  28.51 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  27.53 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  28.51 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 586 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 215 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 215 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 229 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 244 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 215 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.42 
 
 		 673 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  28.05 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  27.53 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  27.49 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 623 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.55 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.39 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 712 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 205 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1987 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>