More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1537 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  75.11 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  66.81 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  75.44 
 
 		 229 aa  299  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  72.05 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  71.18 
 
 		 229 aa  281  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  67.69 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  47.8 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  49.7 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  50.24 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.01 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.78 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.76 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  42.95 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.3 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  45.2 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  44.37 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.09 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.2 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  38.31 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  39.11 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  41.26 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  43.26 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.67 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.61 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.76 
 
 		 351 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.98 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.19 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.72 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  38.69 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  39.31 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.84 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  42.86 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  42.75 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  37.26 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  37.97 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.48 
 
 		 447 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.86 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.86 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.86 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.15 
 
 		 429 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.35 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.35 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.42 
 
 		 344 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  43.7 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.37 
 
 		 327 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.11 
 
 		 345 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.2 
 
 		 319 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.42 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  38.67 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.67 
 
 		 344 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.15 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35 
 
 		 350 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  42.03 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35 
 
 		 350 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  37.96 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 459 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.96 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.26 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  33.82 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.8 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.67 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  36.48 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.68 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.92 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.75 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  37.68 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.69 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.14 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  42.03 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.41 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.53 
 
 		 337 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>