More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0280 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 		 533 aa  1082    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  94.93 
 
 		 533 aa  1005    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  54.9 
 
 		 537 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0306  hypothetical protein  25.85 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0279  hypothetical protein  26.1 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  42.59 
 
 		 266 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  47.42 
 
 		 334 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 193 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  45.54 
 
 		 330 aa  97.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 319 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 320 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 219 aa  93.2  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.86 
 
 		 429 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  37.96 
 
 		 277 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.76 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 242 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 230 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.51 
 
 		 311 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 218 aa  91.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 218 aa  91.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 240 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 212 aa  91.3  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 296 aa  90.9  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 219 aa  90.5  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 502 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 210 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.86 
 
 		 212 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 316 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 231 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  41.88 
 
 		 239 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.54 
 
 		 375 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 222 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 214 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.83 
 
 		 217 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  36.52 
 
 		 517 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 225 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.14 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 209 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.13 
 
 		 694 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  34.75 
 
 		 670 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 440 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.45 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 1755 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.64 
 
 		 525 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 217 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.92 
 
 		 209 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 468 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 432 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 374 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 209 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 364 aa  87  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 316 aa  87  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 704 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.25 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.4 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 294 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.81 
 
 		 310 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  47.78 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.22 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.61 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  38.89 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.89 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  38.89 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  38.89 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.54 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  38.89 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.18 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  38.89 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.93 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.64 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  37.04 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>