More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2923 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1182    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  60.69 
 
 		 584 aa  316  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  60.69 
 
 		 584 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 		 537 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  29.67 
 
 		 533 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.07 
 
 		 266 aa  87  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  29.39 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  29.3 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 1026 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  35.9 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 623 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  37.9 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 525 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.1 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.43 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.47 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4427  hypothetical protein  27.18 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  30.97 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  49.32 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  31.86 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  27.18 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.68 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  31.84 
 
 		 263 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  25.2 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  52.78 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 		 263 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 262 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  49.33 
 
 		 417 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  27.35 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.61 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  42.05 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6370  hypothetical protein  30.63 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  27.35 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  25.73 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.54 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  25.73 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  43.18 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  39.05 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  37.74 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  25.3 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  37.14 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.65 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 193 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.85 
 
 		 222 aa  70.1  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.82 
 
 		 1313 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.17 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.8 
 
 		 890 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 543 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 729 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.42 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.24 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 169 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.89 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.94 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  24.5 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.86 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  47.3 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>