More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6202 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  95.45 
 
 		 220 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  89.55 
 
 		 220 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  89.55 
 
 		 220 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  89.55 
 
 		 220 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  89.55 
 
 		 220 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  57.59 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  62.12 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  58.62 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  58.62 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  58.62 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  57.97 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.93 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  46.47 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.09 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.26 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.17 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  35.05 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  35.24 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  46.72 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.44 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.11 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.74 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.73 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50.5 
 
 		 321 aa  92.4  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.64 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 459 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  43.24 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  48.51 
 
 		 334 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  49.5 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  43.64 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  43.64 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.24 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  48.54 
 
 		 318 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.08 
 
 		 445 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  56.41 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  45.16 
 
 		 464 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  45.37 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.94 
 
 		 352 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.28 
 
 		 607 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  59.15 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39.62 
 
 		 509 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  57.75 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  40.54 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 499 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  41.9 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  42.5 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  37.13 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  53.52 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.16 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.86 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  47.66 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>