More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3646 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 587 aa  1159    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  38.73 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  31.69 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 		 552 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  31.63 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  31.63 
 
 		 578 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  31.63 
 
 		 578 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 569 aa  194  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  32.03 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  28.11 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  31.06 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  30.84 
 
 		 558 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  30.84 
 
 		 558 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  30.34 
 
 		 542 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  25.33 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  25.33 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  24.89 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 270 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  46.9 
 
 		 231 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 270 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  33.33 
 
 		 270 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 270 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 270 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 270 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 416 aa  88.2  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  39.68 
 
 		 270 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.36 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.21 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  43 
 
 		 890 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 263 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.21 
 
 		 607 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.64 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.45 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.45 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.51 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  40.71 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.34 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.34 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.02 
 
 		 609 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.35 
 
 		 620 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  31.63 
 
 		 269 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.52 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 		 242 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  31.63 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  32.07 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  39.22 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  46.81 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.07 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 189 aa  76.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  32.19 
 
 		 185 aa  77  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.14 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.93 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.55 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  33.11 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 224 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 219 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>