More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0781 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  77.5 
 
 		 578 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  78.38 
 
 		 578 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  77.5 
 
 		 578 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1157    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  46.35 
 
 		 569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  40.14 
 
 		 550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  37.87 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  33.07 
 
 		 575 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  31.78 
 
 		 572 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 		 587 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  55.97 
 
 		 383 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 		 555 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  29.6 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  29.12 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  29.12 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  28.92 
 
 		 542 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  38.98 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  38.14 
 
 		 560 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.12 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.12 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.78 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  36.67 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.98 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 727 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.19 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.5 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 210 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.29 
 
 		 607 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 243 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.64 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 236 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 210 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.4 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.2 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  35.07 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  37.84 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  41.35 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  41.35 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.17 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  36.28 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.17 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  41.58 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.59 
 
 		 609 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  41.58 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  41.58 
 
 		 235 aa  73.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.1 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  41.28 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 242 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 231 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  41.28 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 224 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 219 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.03 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.03 
 
 		 233 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 240 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>