More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2703 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
560 aa  1151    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  97.32 
 
 
560 aa  1122    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  97.32 
 
 
560 aa  1122    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  27.38 
 
 
555 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  25.67 
 
 
552 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  24.39 
 
 
558 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  24.72 
 
 
558 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  24.07 
 
 
542 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  24.72 
 
 
558 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  36.62 
 
 
572 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 
587 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.29 
 
 
575 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  25.76 
 
 
569 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  22.33 
 
 
550 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  38.33 
 
 
578 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
576 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  38.14 
 
 
573 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
578 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 
578 aa  87  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  42.99 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  34.35 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.56 
 
 
261 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
364 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.56 
 
 
261 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
227 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.72 
 
 
230 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.68 
 
 
620 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
537 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
443 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
543 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
237 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 
417 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
459 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
215 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.25 
 
 
260 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
262 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  35.71 
 
 
218 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 
525 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.2 
 
 
1026 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.25 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  46.75 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  35.9 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.14 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35.85 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.84 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  38.1 
 
 
658 aa  74.7  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.85 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  39.13 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.24 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  35.79 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35.04 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.64 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  36.84 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.64 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  44.57 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.79 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.81 
 
 
240 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  34.91 
 
 
310 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.64 
 
 
227 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  37.21 
 
 
252 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.62 
 
 
707 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  32.03 
 
 
233 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  38.04 
 
 
316 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  38.64 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  33.98 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 
630 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  38.64 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.91 
 
 
641 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 
468 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>