More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0131 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  98.89 
 
 
558 aa  1083    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  98.52 
 
 
558 aa  1081    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  85.61 
 
 
558 aa  948    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  100 
 
 
542 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  47.21 
 
 
552 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  46.2 
 
 
555 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  42.93 
 
 
575 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  30.28 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  28.98 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  24.07 
 
 
560 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  25.09 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  25.09 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 
569 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 
576 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  32.11 
 
 
578 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  32.11 
 
 
578 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 
578 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  28.92 
 
 
573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  30.61 
 
 
550 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 
383 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
270 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  43.75 
 
 
235 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.6 
 
 
241 aa  87.4  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 
296 aa  87  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  38.79 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  31.94 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.81 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40.2 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
224 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 
229 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  41.75 
 
 
261 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  44.05 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40 
 
 
218 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.59 
 
 
230 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  47.37 
 
 
223 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.77 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.26 
 
 
215 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  40.68 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.92 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.92 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  39.39 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  42.99 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.51 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  48.1 
 
 
591 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.56 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.11 
 
 
212 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  48.81 
 
 
262 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.12 
 
 
264 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 
241 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 
223 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  35.97 
 
 
241 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
219 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 
263 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  35.9 
 
 
533 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  51.32 
 
 
222 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
230 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.42 
 
 
222 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
190 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 
263 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  51.32 
 
 
220 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.14 
 
 
321 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.24 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  53.52 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.24 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.13 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.16 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.82 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.59 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  40.95 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  35.04 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  45.24 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.57 
 
 
260 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  43.53 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.75 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  48.68 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  50.68 
 
 
210 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>